多肽合成氨基酸连不上的原因可能有以下几点：

1.  化学反应不兼容：在多肽合成过程中，氨基酸之间需要通过脱水缩合反应形成肽键。然而，并非所有的氨基酸都能顺利地进行这种反应。有些氨基酸之间可能存在化学不兼容性，导致它们无法形成稳定的肽键。例如，酸性氨基酸(如天冬氨酸和谷氨酸)和碱性氨基酸(如赖氨酸和精氨酸)之间的反应可能会受到pH值、温度和催化剂等因素的影响，从而导致反应失败。

2.  空间位阻：在多肽链中，氨基酸之间可能存在空间位阻现象。这意味着某些氨基酸的空间结构可能阻碍了其他氨基酸的参与反应。例如，较大的氨基酸可能占据了较小氨基酸的活性位点，使得它们无法顺利地形成肽键。

3.  能量障碍：在多肽合成过程中，氨基酸之间的脱水缩合反应需要消耗一定的能量。如果反应过程中的能量障碍较大，例如高能磷酸盐的供应不足或者酶的活性不足等，那么氨基酸之间的反应就可能无法顺利进行。

4.  错误底物：在多肽合成过程中，有时可能会出现错误的底物参与反应的情况。这可能导致氨基酸之间无法形成稳定的肽键，从而影响多肽的合成。

5.  催化剂失活：在多肽合成过程中，催化剂起着至关重要的作用。然而，催化剂可能会受到某些因素的影响而失活，例如温度、pH值、金属离子浓度等。如果催化剂失活，那么氨基酸之间的反应就可能无法顺利进行。

6.  底物浓度不足：在多肽合成过程中，底物的浓度对于反应的成功至关重要。如果底物浓度不足，那么氨基酸之间的反应就可能无法顺利进行。

总之，多肽合成氨基酸连不上的原因可能有很多，需要根据具体情况进行分析和解决。在实际操作中，可以通过优化反应条件、选择合适的底物和催化剂等方法来提高多肽合成的成功率。

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