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常用的荧光基团和淬灭基团组合有那些?

作者:9159金沙游戏场发表时间:2024-03-25浏览量:167

荧光和淬灭是分子生物学、生物化学和相关领域中常用的两种技术,它们在实时定量PCR(qPCR)、荧光共振能量转移(FRET)和生物传感器等应用中具有重要作用。荧光基团能够吸收特定波长的光并发射不同波长的光,而淬灭基团则能吸收或减弱荧光基团的荧光。


以下是一些常用的荧光基团和淬灭基团的组合:


1. FAM(Fluorescein)与TAMRA:FAM是一种常用的荧光素,其发射光谱为绿色,而TAMRA是一种红色的淬灭基团。当FAM与TAMRA靠近时,TAMRA可以吸收FAM的绿色荧光,从而发生淬灭。这种组合常用于TaqMan探针中。


2. Cy5与BHQ-3:Cy5是一种近红外荧光染料,其发射波长在665 nm左右,BHQ-3是一种黑色的淬灭剂,能有效淬灭Cy5的荧光。这种组合适用于多重检测,因为Cy5的发射波长与其他常见荧光染料的波长不重叠。


3. ROX与Dabcyl:ROX是一种红色荧光染料,其发射波长约为608 nm,Dabcyl是一种非荧光的淬灭剂。当ROX与Dabcyl结合时,Dabcyl能有效淬灭ROX的荧光。这种组合通常用于双重标记的探针中。


4. EvaGreen与None:EvaGreen是一种高度敏感的DNA染料,它在没有结合到双链DNA时几乎不发出荧光,但当与双链DNA结合时,其荧光强度显著增强。因此,它不需要淬灭剂就能工作,这种特性使得EvaGreen非常适合用于实时PCR中。


5. SYBR Green I与None:SYBR Green I是一种常用的双链DNA染料,它在结合到双链DNA时发出强烈的绿色荧光。与EvaGreen类似,SYBR Green I也不需要淬灭剂就能工作。


这些组合的选择取决于实验的具体需求,包括所需的灵敏度、特异性以及检测设备的能力。在设计实验时,研究人员会根据目标序列的大小、探针的设计以及检测平台的特点来选择最合适的荧光和淬灭基团组合。

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