多肽液相合成保护基选择是多肽化学合成中的一个重要环节，它直接影响到多肽的纯度和产率。保护基的选择需要考虑以下几个因素：

1. 稳定性：保护基需要具有良好的稳定性，能够在反应条件下保持其结构不变。如果保护基在反应过程中发生裂解，可能会导致多肽链的断裂或者交联。

2. 选择性：保护基需要具有良好的选择性，能够有效地保护多肽链上的特定氨基酸。如果保护基的选择性不好，可能会导致多肽链上的其他氨基酸被误保护，从而影响多肽的结构和功能。

3. 脱除性：保护基需要具有易于脱除的性质，以便在合成完成后能够方便地将保护基从多肽链上去除。如果保护基的脱除性差，可能需要使用更复杂的方法来去除保护基，这将增加合成的复杂性和成本。

4. 兼容性：保护基需要与多肽链上的其他部分以及合成中使用的其他试剂兼容。如果保护基与其他部分或试剂不兼容，可能会导致反应的失败或者多肽链的破坏。

常见的多肽液相合成保护基包括Fmoc、Trt、Alloc、Teoc等。其中，Fmoc（9-芴甲氧羰基）是目前最常用的保护基，它具有稳定性好、选择性高、脱除性好等优点。然而，Fmoc的保护基团较大，可能会影响多肽链的构象和功能。因此，在选择保护基时，需要根据具体的合成目标和条件进行综合考虑。

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