固相多肽合成（Solid Phase Peptide Synthesis, SPPS）是一种在固体支持物表面逐步合成多肽链的方法。这种方法由R. Bruce Merrifield于1963年提出，为多肽化学合成领域带来了革命性的变化，极大地推动了多肽和蛋白质的研究。

在固相多肽合成中，氨基酸的保护基选择是一个关键步骤。保护基的作用是在合成过程中暂时屏蔽氨基酸的活性官能团，防止不需要的副反应发生，直到特定的步骤需要它们参与反应时才将其除去。常用的保护基包括：

1. **氨基保护基**：用于保护氨基酸的α-氨基，常见的有：

   - Boc (tert-Butyloxycarbonyl)：通过酸处理可以容易地去除。

   - Fmoc (9-Fluorenylmethyloxycarbonyl)：通过弱碱处理可以容易地去除，常用于自动化合成。

   - Alloc：可通过钯催化剂和试剂如吗啉或苯硫酚去除。

2. **羧基保护基**：用于保护氨基酸的羧基，常见的有：

   - Mtt (4-Methyltrityl)：对酸稳定，可通过氟化物离子或低浓度的有机酸如三氟醋酸去除。

   - Allyl：对酸稳定，可通过金属催化剂如钯碳和试剂如吗啉或苯硫酚去除。

3. **侧链保护基**：用于保护氨基酸侧链上的官能团，如：

   - Trt (Trityl)：用于保护组氨酸的咪唑环，通过酸处理去除。

   - Bzl (Benzyl)：用于保护半胱氨酸的巯基，通过氢解去除。

   - Tos (Tosyl)：用于保护精氨酸的胍基，通过酸处理去除。

在选择保护基时，需要考虑以下因素：

- **正交性**：不同的保护基应该在合成的不同阶段选择性地去除，而不影响其他保护基。

- **稳定性**：保护基在整个合成过程中应该保持稳定，直到特定的去除步骤。

- **兼容性**：保护基的引入和去除条件应该与合成步骤兼容，不引起不必要的副反应。

- **效率**：保护基的引入和去除应该高效且易于操作。

正确的保护基选择和策略是成功固相多肽合成的关键。通过精心设计保护基的策略，可以有效地控制多肽链的合成，获得高纯度的目标多肽。

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